2結(jié)果
2.1Rv2029c基因擴(kuò)增結(jié)果
以提取的結(jié)核基因組為模板,在設(shè)計(jì)好的引物作用下,行PCR擴(kuò)增。PCR成功擴(kuò)出Rv2029c DNA,大小1 020 bp。見圖1。
注:1為基因Rv2029c;M為DNA2000標(biāo)記物
圖1結(jié)核DosR基因Rv2029c PCR結(jié)果
2.2pET30a-Rv2029c重組質(zhì)粒的構(gòu)建與鑒定
將挑取的單克隆菌用EcoRⅠ和HindⅢ進(jìn)行雙酶切,酶切鑒定發(fā)現(xiàn),陽性重組質(zhì)粒能切出2條基因片段,分別為質(zhì)粒pET30a(5 422 bp)和插入的目的基因Rv2029c(1 020 bp)。與連接片段大小吻合,可初步認(rèn)為pET30a-Rv2029c構(gòu)建成功。見圖2。
注:M為DNA標(biāo)記物;1~2為陰性質(zhì)粒;3為陽性質(zhì)粒pET30a-Rv2029c
圖2 pET30a-Rv2029c重組質(zhì)粒酶切鑒定結(jié)果
2.3基因測序結(jié)果和GenBank序列
比對(duì)將酶切鑒定成功的重組質(zhì)粒送往南京金斯瑞公司進(jìn)行測序,測序結(jié)果與GenBank所給序列進(jìn)行Blast?;騌v2029c與GenBank中所給序列完全吻合,重復(fù)率100%,基因無突變。
2.4pET30a-Rv2029c促大腸埃希菌生長的統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
將3次測量獲得的資料進(jìn)行重復(fù)測量的方差分析,結(jié)果顯示sum值觀察時(shí)間效應(yīng):不同時(shí)間OD值差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(F=8 351.248,P<0.05),空質(zhì)粒組(pET30a)和重組質(zhì)粒組(pET30a-Rv2029c)不同時(shí)間OD值差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(F=3 593.681、4 125.791,P<0.05)。sum值觀察處理因素效應(yīng),重組質(zhì)粒組(pET30a-Rv2029c)OD值高于空質(zhì)粒組(pET30a)(t=4 416.54,P<0.05)。從各時(shí)間點(diǎn)來看,0~5 h空質(zhì)粒組和重組質(zhì)粒組(pET30a-Rv2029c)OD值差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(t=1.372、1.220、0.894、0.935、0.787、0.395,P>0.05),6~15 h由于加入IPTG誘導(dǎo)了蛋白R(shí)v2029c的表達(dá),OD值差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05);生長時(shí)間和處理因素存在交互效應(yīng)(F=767.049,P<0.05)。見表1。
表1 0~15 h導(dǎo)入Rv2029c對(duì)大腸埃希菌OD值的影響
組別生長時(shí)間(h)101112131415sumFP空質(zhì)粒組x0.605 0.608 0.616 0.610 0.608 0.618 0.411 3 593.6810.000 s0.018 0.007 0.010 0.011 0.014 0.011 0.272重組質(zhì)粒組x1.015 1.057 1.097 1.103 1.164 1.159 0.658 4 125.7910.000 s0.023 0.017 0.027 0.026 0.056 0.022 0.476 sumx0.809 0.832 0.856 0.856 0.885 0.889 0.534*8 351.248*0.000*s0.212 0.231 0.248 0.254 0.289 0.279 0.371*t42.664 70.736 49.077 51.358 28.815 66.182 4 416.540*P0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000 0.000*
2.5pET30a-Rv2029c促大腸埃希菌生長曲線
以生長時(shí)間為橫坐標(biāo),OD值為縱坐標(biāo),繪制出大腸埃希菌生長曲線見圖3。在5 h時(shí)(此時(shí)OD值約為0.45)加入IPTG,空質(zhì)粒組(pET30a)大腸埃希菌在6 h進(jìn)入平臺(tái)期,而重組質(zhì)粒組(pET30a-Rv2029c)卻能繼續(xù)維持對(duì)數(shù)期達(dá)10 h左右,并且突破大腸埃希菌的生長界限,使大腸埃希菌的OD值達(dá)到1.16左右才進(jìn)入平臺(tái)期,若以O(shè)D值反映大腸埃希菌數(shù)量,則重組質(zhì)粒(pET30a-Rv2029c)能促使大腸埃希菌生長量提高1倍。
圖3蛋白R(shí)v2029c促大腸埃希菌生長曲線
3討論
本實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)導(dǎo)入了重組質(zhì)粒pET30a-Rv2029c的大腸埃希菌與不導(dǎo)入該基因的大腸埃希菌相比,存在著某種機(jī)制使大腸埃希菌能夠在低氧、營養(yǎng)物質(zhì)匱乏的環(huán)境下繼續(xù)維持在對(duì)數(shù)生長期,增強(qiáng)了大腸埃希菌抵抗應(yīng)激環(huán)境的能力,增加了大腸埃希菌的數(shù)量。Rv2029c蛋白在Mg2+和ATP的參與下催化6磷酸果糖形成2,6二磷酸果糖,因此在糖代謝中起著重要作用。含有重組質(zhì)粒pET30a-Rv2029c的大腸埃希菌可能通過Rv2029c蛋白,調(diào)節(jié)營養(yǎng)物質(zhì)的供給,提高了對(duì)抗低氧環(huán)境,增加了利用糖酵解的能力,與不含Rv2029c的大腸埃希菌相比突破了糖代謝和糖利用的上限,促進(jìn)了大腸埃希菌的生長。
結(jié)核分枝桿菌的肉芽腫環(huán)境同大腸埃希菌平臺(tái)期環(huán)境相似,都存在營養(yǎng)物質(zhì)匱乏、低氧、代謝產(chǎn)物增加等對(duì)細(xì)菌生存不利的因素,依此推斷,結(jié)核分枝桿菌蛋白R(shí)v2029c可能在肉芽腫環(huán)境組織中起到重要的維持細(xì)菌存活的作用。結(jié)核分枝桿菌在潛伏期為適應(yīng)肉芽腫的微環(huán)境,一方面需要減少自身代謝活動(dòng)從而進(jìn)入休眠期,KUMAR等對(duì)DosR蛋白中的Rv0079(休眠相關(guān)翻譯抑制子DATIN)的研究證實(shí)了這一點(diǎn),發(fā)現(xiàn)此蛋白抑制了大腸埃希菌的生長,這是因?yàn)樵摰鞍着c核糖體30S亞基結(jié)合從而阻斷了蛋白合成中的翻譯過程,降低了細(xì)菌的繁殖速度,使其進(jìn)入休眠期。另一方面結(jié)核分枝桿菌可能需要最大限度利用環(huán)境中營養(yǎng)物質(zhì)、氧氣等滿足自身生存基本需要,本文研究的結(jié)果支持了這一點(diǎn),生物信息學(xué)分析表明蛋白R(shí)v2029c為6-磷酸果糖激酶2,此蛋白屬于pfkB糖激酶超家族,是糖代謝的一種重要信號(hào)酶,通過影響2,6二磷酸果糖的水平實(shí)現(xiàn)對(duì)糖酵解通路的調(diào)節(jié),增強(qiáng)了結(jié)核分枝桿菌在肉芽腫環(huán)境中最大程度利用氧氣和營養(yǎng)物質(zhì)的能力,維持結(jié)核分枝桿菌生存基本需求。進(jìn)一步研究該蛋白促進(jìn)細(xì)菌糖酵解的具體機(jī)制是下一步研究的方向。
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