【摘要】:作為21世紀(jì)帶動人類發(fā)展的關(guān)鍵性技術(shù)之一,微生物技術(shù)被不斷應(yīng)用在環(huán)境治理、發(fā)酵工業(yè)、醫(yī)療健康等領(lǐng)域。微生物生長動力學(xué)模型以數(shù)學(xué)的形式對微生物生長進(jìn)行了定量描述,已建立的模型有Logistic、Gompertz、Schunte、Lopz等模型,這些模型描述了微生物數(shù)量隨生長時間的對應(yīng)關(guān)系。這些模型也被不斷應(yīng)用于平板菌落記數(shù)法、PCR技術(shù)、生物芯片技術(shù)、微熱量法等測量結(jié)果與微生物生長數(shù)量線性相關(guān)的檢測方法上。但是,對于一些在生長過程中不斷累積的代謝產(chǎn)物,如耗氧量、粘度、電阻抗等的測量結(jié)果,它們與微生物生長緊密相關(guān),但目前仍然沒有與之對應(yīng)的、能給出微生物生長參數(shù)的、描述其與微生物生長時間之間關(guān)系的動力學(xué)模型。據(jù)此,論文對現(xiàn)有的Logistic模型、Gompertz模型、Baranyi模型、Huang模型這四個模型進(jìn)行了研究,分析了模型所描述的S型曲線以及模型含有的各參數(shù)對模型的影響,探索了將現(xiàn)有模型直接用于代謝產(chǎn)物法的微生物生長研究的可能性。
研究結(jié)果發(fā)現(xiàn)最大生長量、最大生長速率、遲滯期時長這三個參數(shù)對于不同的模型的影響是相同的,其值的增大分別對應(yīng)著模型最大值、拐點(diǎn)斜率以及拐點(diǎn)切線與坐標(biāo)軸焦點(diǎn)的增大。其中Logistic模型、Gompertz模型由于其數(shù)學(xué)表達(dá)式的限制,模型中僅含有三個階段(遲滯期,指數(shù)增長期,穩(wěn)定期),且Baranyi模型為中心對稱關(guān)系,所以這三種模型都不適合直接用于代謝產(chǎn)物的描述;Huang模型所描述的曲線雖然能夠與代謝產(chǎn)物累積量曲線相對應(yīng),但是進(jìn)一步對模型分析發(fā)現(xiàn),在對代謝產(chǎn)物進(jìn)行時,Huang模型對于微生物死亡期的描述是不符合實(shí)際的。于是本文以微生物生長遲滯期、指數(shù)增長期、穩(wěn)定期、衰亡期這四個階段為前提,從微生物生長模型中對各參數(shù)定義出發(fā),以Huang模型為基礎(chǔ)提出了一種新的基于代謝產(chǎn)物的微生物生長動力學(xué)模型,以此來描繪代謝產(chǎn)物累積量曲線并從中獲取微生物的遲滯期、最大生長速率、死亡速率等生長參數(shù),并且依據(jù)所提及過的四個模型對新建立模型中的參數(shù)進(jìn)行了驗(yàn)證。同時,本文以金黃色葡萄球菌與酵母菌生長過程中產(chǎn)生的CO_2作為代謝產(chǎn)物的指標(biāo),以平均相對誤差絕對值(MARE)、估計(jì)標(biāo)準(zhǔn)誤差(SEP)、均方根誤差(RMSE)作為評估參數(shù),結(jié)合擬合圖像,對新模型在實(shí)際測量中的應(yīng)用進(jìn)行了驗(yàn)證。
結(jié)果表明對于產(chǎn)物累積量曲線明顯不對稱的S型曲線而言,Gompertz模型比Logistic模型、Baranyi模型更合適,而對于產(chǎn)物累積量曲線中心對稱的曲線而言結(jié)果則相反,但是Huang模型和新建立的模型則沒有這種偏好,對于兩種曲線都表現(xiàn)出了良好的擬合優(yōu)度和非常小的擬合誤差,Huang模型對金黃色葡萄球菌測量結(jié)果擬合的MARE為0.064,SEP為47.217,RMSE為0.057;對酵母菌測量結(jié)果擬合的MARE為0.055,SEP為26.769,RMSE為1.0378,新建立模型對對金黃色葡萄球菌測量結(jié)果擬合的MARE為0.039,SEP為35.985,RMSE為0.05;酵母菌測量結(jié)果擬合的MARE為0.042,SEP為14.302,RMSE為0.012。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,當(dāng)測量結(jié)果為微生物生長中不斷累積的代謝產(chǎn)物時,新模型能夠較好地對其進(jìn)行表述。
最后,本文對25℃下的金黃色葡萄球菌、白色念珠菌和酵母菌進(jìn)行了測量,給出了其生長動力學(xué)函數(shù)以及各階段生長參數(shù)。并且在24-34℃的范圍內(nèi)研究了溫度對微生物生長帶來的影響,結(jié)果表明在這個溫度范圍內(nèi),溫度的升高能提高最大生長速率、減小遲滯期時長,但是在超過了最適生長溫度后,反而會使得最大生長速率下降,這個結(jié)果也與文獻(xiàn)一致。本文針對在微生物生長過程中不斷累積的代謝產(chǎn)物,建立了一種新的基于代謝產(chǎn)物的微生物生長動力學(xué)模型,并以CO_2為例對模型的實(shí)際應(yīng)用進(jìn)行了驗(yàn)證。新建立的模型可以用于擬合不同溫度、PH等環(huán)境條件下的微生物生長,獲取完整的微生物生長曲線以及代謝產(chǎn)物測量方法下的微生物各個階段的生長參量。
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