2016年是“十三五”開局之年，各項醫(yī)改有序推進、成效明顯。監(jiān)測數(shù)據(jù)表明，我國醫(yī)改試點城市擴大到200個，2335家公立醫(yī)院全面實施改革。各項醫(yī)改呈現(xiàn)兩升兩降良好態(tài)勢：居民健康水平持續(xù)上升，衛(wèi)生資源配置水平得到提升；醫(yī)療費用增長幅度持續(xù)下降，居民就醫(yī)負(fù)擔(dān)不斷減輕。2016年試點城市公立醫(yī)院門診費用及住院費用構(gòu)成中，藥占比分別為49%和34.2%，較2015年下降了2和2.5個百分點。

醫(yī)改取得成效的同時，個別領(lǐng)域仍有待深化改革。國家衛(wèi)計委相關(guān)負(fù)責(zé)人表示，按照國務(wù)院醫(yī)改任務(wù)要求，2017年9月底前我國公立醫(yī)院要全面取消藥品加成，這是破除“以藥養(yǎng)醫(yī)”的關(guān)鍵一步。但是目前仍有部分國有企業(yè)、監(jiān)獄系統(tǒng)等公立醫(yī)院未能按要求推進藥品集中招標(biāo)采購和耗材陽光采購，部分省份已參加公立醫(yī)院改革的公立醫(yī)院還沒有全部取消藥品加成，公立醫(yī)院門診及住院費用中耗材檢查費用占比仍然較高。

監(jiān)測數(shù)據(jù)還表明，目前全國三項基本醫(yī)保參保（參合）人數(shù)達13.4億，參保率達98.8%。全國70.6%的公立醫(yī)院在省級藥品集中采購平臺采購藥品，57.0%的公立醫(yī)院在省級平臺集中采購高值醫(yī)用耗材。我國非公立醫(yī)療機構(gòu)達44.1萬個；多點執(zhí)業(yè)醫(yī)師數(shù)達19219人。

按照“?；?、強基層、建機制”的改革要求，2017年全國深化醫(yī)改提出了56項重點工作，主要圍繞分級診療、公立醫(yī)院改革、全民醫(yī)保、藥品供應(yīng)保障、綜合監(jiān)管等制度提出具體任務(wù)，對健康扶貧、基層公共衛(wèi)生服務(wù)等方面也提出了具體要求。